A história de Railgun gira em torno de uma cidade-escola, onde 80% de seus habitantes são estudantes. A cidade também tem tecnologia de ponta, mais avançada do que todo o restante do mundo. Os estudantes estudam poderes psiquicos! O anime irá dar atenção à estudante Misaka Mikoto, que tem poderes de nível 5, o mais alto de toda a escola.
